一部代位弁済による移転登記がされている根抵当権について、残債権の債権譲渡による移転登記の登録免許税はどのように計算するのでしょうか。想定しづらいので具体的ケースで説明します。

【具体例】

• Ａ銀行の極度額１０００万円の根抵当権が設定されている。（確定済み）
• Ｂ保証協会が一部代位弁済し、Ａ銀行からＢ信保へ根抵当権の一部移転登記がなされている。
• Ａ銀行は代位弁済後の残債権について、Ｘに債権譲渡した。

この場合のＡ銀行からＸへの根抵当権移転登記の登録免許税はいくらとなるでしょうか。

＜ケース１：一部代位弁済の額と、譲渡債権額の合計が極度額に満たない場合＞

極度額：１０００万円
一部代位弁済額：６００万円
譲渡債権額：３００万円の場合
譲渡債権額の３００万円を課税標準として
300万円　×　2/1000　＝　6000円

＜ケース２：一部代位弁済の額と、譲渡債権額が極度額を超える場合＞

極度額：１０００万円
一部代位弁済額：６００万円
譲渡債権額：８００万円の場合
１０００万円－６００万円＝４００万円と差額：４００万円を課税標準として
400万円　×　2/1000　＝　8000円
この根抵当権には４００万円分の力しか残ってない、と考える。

＜ケース３：そもそもの一部代位弁済の額が極度額を超える場合＞

極度額：１０００万円
一部代位弁済額：１２００万円
譲渡債権額：３００万円の場合
不動産の件数×１５００円
そもそもこの根抵当権には力（優先弁済効）が残ってない抜け殻、と考える。（参照：登記研究６８１号）
※ただし、筆者の経験上、上記以外の取り扱いでも通った登記所があるので、念のため管轄登記所に確認するころをお勧めします。